Bonsoir,
en fonction du groupe de bannières dont elle fait partie, BannersAll, WideBanners ou SideBox Banners, il faut indiquer la position qu'elle doit prendre dans Configuration/Layout Settings/Banner Display Groups - Header Position 1, 2 ou 3. (désolé, ma partie configuration de l'admin est en anglais).
Si les problèmes persistent faudra consulter un spécialiste

Plus sérieusement si la bannière malgré les essais que tu vas faire ne se positionne toujours pas exactement à l'endroit ou tu le souhaites, utilise la méthode indiquée dans la FAQ Collaborative
http://www.zencart-france.com/forum/faq-collaborative/modification-des-css-savoir-ou-intervenir-debutant-t2201.0.html et tu verras ou dans les css il faut que tu fasses des modifications
En drenier recours tu peux aussi modifier le template, mais avant de le faire pense à le dupliquer à le renommer afin de pouvoir toujours revenir en arrière, c'est là la force de ZC donc faut pas s'en priver.
Allez bon courage, et bonne nuit